En Corpogen realizamos investigación básica y aplicada en el área de la microbiología, con diversos proyectos nacionales e internacionales. Los tres grupos de investigación son:

  • Biotecnología Molecular
  • Genética Molecular 
  • Bioinformática

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Investigación

Proyectos

Resistencia microbiana y adaptación

  • Adquisición de resistencia y persistencia en aislamientos clínicos de Klebsiella pneumoniae.

  • Biopelículas y comunidades microbianas asociadas a tubos orotraqueales en pacientes en unidades de cuidado intensivo.

Diversidad microbiana

  • Identificación y conservación de microorganismos aislados de suelos y aguas de diversos hábitats extremos en el país. 

  • Comunidades microbianas asociadas a líquenes de páramo

  • Microorganismos en el sistema de bus Transmilenio en Bogotá

 

Biomarcadores en Mycobacterium tuberculosis

  • Diagnóstico molecular 

  • Transcriptómica

Metabolitos y enzimas microbianas

  • Identificación y estudio de grupos de genes biosintéticos en cepas de Streptomyces

  • Estudio de enzimas microbianas para favorecer cultivos de hongos comestibles

  • Desarrollo de un sistema molecular para aumentar expresión de genes en librerías metagenómicas. 

Bioinformática

  • Análisis del potencial metabólico en genomas y metagenomas 

  • Identificación de enzimas en metagenomas

Publicaciones recientes

 
  • Genetic and Bioinformatic Strategies to Improve Diagnosis in Three Inherited Bleeding Disorders in Bogotá, Colombia. Lago et al. Genes (Basel). 2021 Nov 18;12(11):1807. doi: 10.3390/genes12111807.

  • Annotating unknown species of urban microorganisms on a global scale unveils novel functional diversity and local environment association. Wu et al. Environ Res. 2021 Oct 9;112183. doi: 10.1016/j.envres.2021.112183.

  • A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance. Danko et al. Cell. 2021 Jun 24;184(13):3376-3393.e17. doi: 10.1016/j.cell.2021.05.002. Epub 2021 May 26.

  • Dissecting industrial fermentations of fine flavour cocoa through metagenomic analysis. Fernández-Niño et al.  Sci Rep. 2021 Apr 21;11(1):8638. doi: 10.1038/s41598-021-88048-3.

  • COVID-19 drug practices risk antimicrobial resistance evolution. Afshinnekoo et al. Lancet Microbe. 2021 Apr;2(4):e135-e136. doi: 10.1016/S2666-5247(21)00039-2. Epub 2021 Feb 24.

  • The effect of aminoglycosides on horizontal gene transfer in Klebsiella pneumoniae. Acosta IA et al. Rev. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat. 2020. 44(170):105-120.Cell. 2021 Jun 24;184(13):3376-3393.e17. doi: 10.1016/j.cell.2021.05.002. Epub 2021 May 26.

  • The Microbiomes of Seven Lichen Genera Reveal Host Specificity, a Reduced Core Community and Potential as Source of Antimicrobials. Sierrra MA et al. Front. Microbiol. 2020. 11:398. doi: 10.3389/fmicb.2020.00398

  • Detection and Quantification of HspX Antigen in Sputum Samples Using Plasmonic Biosensing: Toward a Real Point-of-Care (POC) for Tuberculosis Diagnosis. Pelaez et al. ACS Infect Dis. 2020 May 8;6(5):1110-1120. doi: 10.1021/acsinfecdis.9b00502. Epub 2020 Apr 14.

  • Design and validation of a transposon that promotes expression of genes in episomal DNA. Mongui et al. J Biotechnol. 2020 Feb 20;310:1-5. doi: 10.1016/j.jbiotec.2020.01.007. Epub 2020 Jan 16.

  • Computational search for UV radiation resistance strategies in Deinococcus swuensis isolated from Paramo ecosystems. Díaz-Riaño. PLoS One. 2019 Dec 2;14(12):e0221540.doi: 10.1371/journal.pone.0221540. eCollection 2019.

  • Bogotá River anthropogenic contamination alters microbial communities and promotes spread of antibiotic resistance genes. Posada-Perlaza CE et al. Sci Rep. 2019 Aug 13;9(1):11764. doi: 10.1038/s41598-019-48200-6. PMID:31409850

  • Global phylogeography and ancient evolution of the widespread human gut virus crAssphage. Edwards RA et al. Nat Microbiol. 2019 Oct;4(10):1727-1736. doi: 10.1038/s41564-019-0494-6. PMID: 31285584.

  • Recovery and functional validation of hidden soil enzymes in metagenomic libraries. Calderon D et al. MicrobiologyOpen. 2019 Apr;8(4):e00572. doi: 10.1002/mbo3.572. Epub 2019 Mar 9. PMID: 30851083

 

  • Hypoxia Is Not a Main Stress When Mycobacterium tuberculosis Is in a Dormancy-Like Long-Chain Fatty Acid Environment. Del Portillo P et al. Front Cell Infect Microbiol. 2019 Jan 9;8:449. doi: 10.3389/fcimb.2018.00449. eCollection 2018. PMID:30687646