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Logros (Institucionales, de miembros de la
Comunidad & Publicaciones)
Actualización: Julio de 2010
Logros Institucionales
CorpoGen
participa en proyectos aprobados y financiados
por entidades nacionales e internacionales
CorpoGen hace parte de dos Centros de
Investigación de Excelencia apoyados por
Colciencias:
En 2010
CorpoGen continua siendo la
institución líder en el establecimiento de la
metagenómica como disciplina clave en la
investigación de microorganismos ambientales, y
para recuperar funciones que no están
representadas en cultivos microbianos puros.
CorpoGen fué la única institución en
Colombia con cuatro nuevos proyectos (uno
internacional y tres nacionales) financiados
para iniciar en 2010 en temáticas de
investigación metagenómica, tanto en
metagenómica dependiente de secuencia como en
metagenómica basada en detección de actividades
(funcional), integrando a temas de investigación
ambiental, agricultural o biomédicos, las
herramientas y lógicas utilizadas en ecología
microbiana y metagenómica. Dichos proyectos
dan continuidad a los esfuerzos
de implementación de infraestructura
para realizar genómica microbiana en el país
como parte de los proyectos ien ejecución
previos.
Durante el 2009
CorpoGen realizó el
desarrollo experimental y de diseño de análisis bioinformáticos,
en colaboración en implementación grupo de la
Prof. S. Restrepo
[|],
logrando las primeras exploraciones
metagenómicas que se han realizado en el país
aplicando tecnologías de pirosecuenciación
(454) de ADN
ambiental de suelos neotropicales andinos de
origen agricultural o de suelos
con menor intervención, así como de
aguas provenientes de fuentes termales
andinas. También CorpoGen ha construido,
en colaboración con el grupo del Prof. C. López, las
primeras
librerías metagenómicas en fósmidos,
constituyéndo a CorpoGen como
la institución pionera y
referente nacional de metagenómica basada en
secuenciación y de recuperación de funciones en
Colombia
Desde 2008,
CorpoGen coordina uno de
los 7 Centros de Excelencia de Colciencias, con
el proyecto
Centro Colombiano de Genómica y
Bioinformática de Ambientes Extremos - GeBiX
que consiste en un consorcio de laboratorios de
investigación en 8 instituciones del país,
CorpoGen, Universidad de los Andes, Pontificia
Universidad Javeriana, Universidad Nacional de
Colombia Sede Bogotá, Universidad del Valle,
Universidad de Caldas, Universidad del Cauca,
Parquesoft.
Proyecto dirigido por Maria Mercedes Zambrano,
Directora Científica de
CorpoGen. Más información en:
www.gebix.org.co
El Grupo de
Biotecnología Molecular de CorpoGen
participa en el Centro
Colombiano de Investigación en Tuberculosis
(CCITB), un centro de excelencia
financiado por Colciencias en el periodo
2004-2009, consistente en un consorcio de
laboratorios de instituciones de investigación
nacionales tales como el CIB-Medellín, la
Universidad de Antioquia, la Universidad del
Cauca, el CIDEIM, y el Instituto Nacional de
Salud.
CorpoGen participa en el
proyecto "Estudio
de microorganismos y metabolismo edáfico para
contribuir al diagnóstico de calidad de suelos
de cultivos de papa criolla". En
tal proyecto, financiado por el Ministerio de
Agricultura y Desarrollo Rural, coordinado por
el Prof. Daniel Uribe, participan entre otros,
grupos de investigación de
Biotecnología Molecular de Corpogen
(Patricia Del Portillo), y la
Unidad de Bioinformática del Laboratorio
de Micología y Fitopatología de la Universidad
de los Andes
(Silvia Restrepo) e
Participación en proyectos
internacionales financiados por la “Comunidad
Económica Europea”:
European Comission project (FP7): MAGICPAH -
Molecular Approaches and MetaGenomic
Investigations for optimizing Clean-up of PAH
contaminated sites
Improved diagnosis, drug resistance,
detection and control of tuberculosis in Latin
America (ICA4-CT-2001-10087)
Regulation of cell cycle and dormancy in
M. tuberculosis (INCO project
ICA4-CT-2002-1063)
Development of a molecular platform for
the simultaneous detection of
M.
tuberculosis resistance to rifampicin and
fluoroquinolones (LSHP-CT-2004-516028)
Logros de miembros de la
Comunidad (CorpoGénicos)
Alejandro Reyes,
microbiólogo y quién fué investigador de
CorpoGen, ha publicado como primer autor
un trabajo sobre contenido y diversidad
viral en el intestino humano
en la revista
Nature, una de las
revistas científicas más importantes del mundo.
Howard Junca,
PhD en Genética y Bioquímica Microbiana
y actualmente
investigador de CorpoGen, obtuvo financiación
como investigador principal para dos de un total
nacional de once proyectos financiados en el
2009 por el programa de Biotecnología de
Colciencias, y son las únicas dos propuestas del
total de 55 aprobadas dentro de tal programa que
son en investigación metagenómica, consolidando
a CorpoGen como el pionero y referente de ésta
disciplina en Colombia. Adicionalmente logró la
inclusión de CorpoGen como
socio en un consorcio
Europeo de investigación en metagenómica
financiado dentro del séptimo programa marco de
la comisión europea (FP7). Todos los proyectos
se han iniciado en el 2010. Es la primera
participación de un grupo colombiano en un
proyecto europeo de investigación en
microbiología ambiental o ecología microbiana en
el FP7.
Andrés Cubillos,
microbiólogo
investigador de CorpoGen, fué premiado con una
beca del Instituto Tecnológico de Massachusetts
(Massachusetts
Institute of Technology - MIT) para
realizar sus estudios de doctorado en el
programa de Microbiología, que inició en
Septiembre de 2009. Felicitaciones y mucha
suerte para Andrés!
Andrea Sandoval, microbióloga
investigadora de CorpoGen, fue escogida por el
comité internacional organizador, para ofrecer
una presentación oral en el
30th Annual Congress
of the
European Society of Micobacteriology,
la cual tuvo lugar en Porto, Portugal, el de 5
de Julio de 2009. Tal charla tuvo excelente
aceptación en el público, conformado por los
expertos mundiales más importantes en la
investigación de Tuberculosis. Felicitaciones
para Andrea y gracias tanto por representarnos a
CorpoGen como por representar la investigación
en Micobacterias que se hace en Colombia.
Alejandro Reyes, microbiólogo
investigador de CorpoGen esta realizando desde
el 2007 su tesis
doctoral en el Laboratorio del
Prof. Jeff Gordon, Gordon Lab, School of
Medicine, Washington University in Saint Louis,
el experto mundial que está produciendo los
estudios de mayor impacto en el tema de
microbioma humano. Un merecido lugar para
Alejandro, un joven investigador de capacidad
excepcional. Muchas felicitaciones y le deseamos
lo mejor en sus estudios.
Publicaciones destacadas
Biomédica,
revista producida en Colombia e indexada
internacionalmente que publica tras revisión de
pares artículos de investigación en los temas de
salud más importante del país, acaba de aprobar
para publicación el artículo de los resultados
de investigación conjunta entre CorpoGen
y la Universidad de los Andes, bajo la
autoría de los científicos Diego Chaves,
Andrea Sandoval, Luis Rodríguez, Juan Carlos
García, Silvia Restrepo y Maria Mercedes
Zambrano. Tal artículo, titulado
"Análisis comparativo de seis genomas
del complejo Mycobacterium
tuberculosis" puede ser descargado
aquí
Environmental Microbiology, una
prestigiosa revista internacional de Wiley-
Blackwell Publishing, especializada en la
publicación artículos de investigación en
Microbiología Ambiental y Ecología Microbiana,
ha aceptado el artículo titulado "Metagenomics
reveals diversity and abundance of meta-cleavage
pathways in microbial communities from soil
highly contaminated with jet fuel under air-sparging
bioremediation", con la
coautoría del investigador de CorpoGen,
Howard Junca,
como parte de un trabajo colaborativo de
laboratorios de Alemania y República Checa.
Adicionalmente,
Journal of Bacteriology,
una de las publicaciones emblemáticas de la
Sociedad Estadounidense de Microbiología
(American Society for Microbiology), ha aceptado
para publicación el artículo titulado
Characterization of a gene cluster involved in
4-chlorocatechol degradation by Pseudomonas
reinekei MT1. en el cual
Howard también ha participado como coautor del
estudio.
Horizon Press (Horizon Scientific
Press | Caister Academic Press) ha publicado el
libro "Metagenomics:
Theory, Methods and Applications"
en el cual investigadores de CorpoGen (Andres
Cubillos,
Howard Junca y Maria Mercedes Zambrano)
en conjunto con Investigadores de la Universidad
Javeriana (Sandra Baena e Ivonne Vanegas
Balzer), socios en el centro
GeBiX,
han sido invitados para escribir el capítulo 2 "Beyond
Metagenomics: Integration of Complementary
Approaches for the Study of Microbial
Communities "
BMC Research Notes,
revista de acceso libre publicada por BioMed
Central ha aceptado y publicado el
artículo producido por los investigadores de
CorpoGen, Andrés Cubillos y Maria
Mercedes Zambrano, y Juan Morales de
Ingenian Software, titulado "Analysis
of the genetic variation in
Mycobacterium tuberculosis
strains by multiple genome
alignments". El texto completo de éste
artículo está disponible gratuitamente en los
siguientes vínculos:
Formato PDF
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Formato html
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