Logros (Institucionales, de miembros de la Comunidad & Publicaciones)
Actualización: Julio de 2010
   
 
Logros Institucionales

CorpoGen participa en proyectos aprobados y financiados por entidades nacionales e internacionales

CorpoGen hace parte de dos Centros de Investigación de Excelencia apoyados por
Colciencias:


En 2010 CorpoGen continua siendo la institución líder en el establecimiento de la metagenómica como disciplina clave en la investigación de microorganismos ambientales, y para recuperar funciones que no están representadas en cultivos microbianos puros. CorpoGen fué la única institución en Colombia con cuatro nuevos proyectos (uno internacional y tres nacionales) financiados para iniciar en 2010 en temáticas de investigación metagenómica, tanto en metagenómica dependiente de secuencia como en metagenómica basada en detección de actividades (funcional), integrando a temas de investigación ambiental, agricultural o biomédicos, las herramientas y lógicas utilizadas en ecología microbiana y metagenómica. Dichos proyectos dan continuidad a los esfuerzos de implementación de infraestructura para realizar genómica microbiana en el país como parte de los proyectos ien ejecución previos. 

Durante el 2009 CorpoGen realizó el desarrollo experimental y de diseño de análisis bioinformáticos, en colaboración en implementación grupo de la Prof. S. Restrepo [|], logrando las primeras exploraciones metagenómicas que se han realizado en el país aplicando tecnologías de pirosecuenciación (454) de ADN ambiental de suelos neotropicales andinos de origen agricultural o de suelos con menor intervención, así como de aguas provenientes de fuentes termales andinas. También CorpoGen ha construido, en colaboración con el grupo del Prof. C. López, las primeras librerías metagenómicas en fósmidos, constituyéndo a CorpoGen como la institución pionera y referente nacional de metagenómica basada en secuenciación y de recuperación de funciones en Colombia

Desde 2008, CorpoGen coordina uno de los 7 Centros de Excelencia de Colciencias, con el proyecto Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos - GeBiX que consiste en un consorcio de laboratorios de investigación en 8 instituciones del país, CorpoGen, Universidad de los Andes, Pontificia Universidad Javeriana, Universidad Nacional de Colombia Sede Bogotá, Universidad del Valle, Universidad de Caldas, Universidad del Cauca, Parquesoft. Proyecto dirigido por Maria Mercedes Zambrano, Directora Científica de CorpoGen. Más información en: www.gebix.org.co

El Grupo de Biotecnología Molecular de CorpoGen participa en el Centro Colombiano de Investigación en Tuberculosis (CCITB), un centro de excelencia financiado por Colciencias en el periodo 2004-2009, consistente en un consorcio de laboratorios de instituciones de investigación nacionales tales como el CIB-Medellín, la Universidad de Antioquia, la Universidad del Cauca, el CIDEIM, y el Instituto Nacional de Salud. 


CorpoGen participa en el proyecto "Estudio de microorganismos y metabolismo edáfico para contribuir al diagnóstico de calidad de suelos de cultivos de papa criolla". En tal proyecto, financiado por el Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural, coordinado por el Prof. Daniel Uribe, participan entre otros, grupos de investigación de Biotecnología Molecular de Corpogen (Patricia Del Portillo), y la Unidad de Bioinformática del Laboratorio de Micología y Fitopatología de la Universidad de los Andes (Silvia Restrepo)  e

 

Participación en proyectos internacionales financiados por la “Comunidad Económica Europea”:

European Comission project (FP7):  MAGICPAH - Molecular Approaches and MetaGenomic Investigations for optimizing Clean-up of PAH contaminated sites

Improved diagnosis, drug resistance, detection and control of tuberculosis in Latin America (ICA4-CT-2001-10087)

Regulation of cell cycle and dormancy in M. tuberculosis (INCO project ICA4-CT-2002-1063)

Development of a molecular platform for the simultaneous detection of M. tuberculosis resistance to rifampicin and fluoroquinolones (LSHP-CT-2004-516028)

 

Logros de miembros de la Comunidad (CorpoGénicos)

Alejandro Reyes, microbiólogo y quién fué investigador de CorpoGen, ha publicado como primer autor un trabajo sobre contenido y diversidad viral en el intestino humano en la revista Nature, una de las revistas científicas más importantes del mundo. 

Howard Junca,
PhD en Genética y Bioquímica Microbiana y actualmente investigador de CorpoGen, obtuvo financiación como investigador principal para dos de un total nacional de once proyectos financiados en el 2009 por el programa de Biotecnología de Colciencias, y son las únicas dos propuestas del total de 55 aprobadas dentro de tal programa que son en investigación metagenómica, consolidando a CorpoGen como el pionero y referente de ésta disciplina en Colombia. Adicionalmente logró la inclusión de CorpoGen como socio en un consorcio Europeo de investigación en metagenómica  financiado dentro del séptimo programa marco de la comisión europea (FP7). Todos los proyectos se han iniciado en el 2010. Es la primera participación de un grupo colombiano en un proyecto europeo de investigación en microbiología ambiental o ecología microbiana en el FP7

Andrés Cubillos
, microbiólogo investigador de CorpoGen, fué premiado con una beca del Instituto Tecnológico de Massachusetts (Massachusetts Institute of Technology - MIT) para realizar sus estudios de doctorado en el programa de Microbiología, que inició en Septiembre de 2009. Felicitaciones y mucha suerte para Andrés!
 
Andrea Sandoval, microbióloga investigadora de CorpoGen, fue escogida por el comité internacional organizador, para ofrecer una presentación oral en el 30th Annual Congress of the European Society of Micobacteriology, la cual tuvo lugar en Porto, Portugal, el de 5 de Julio de 2009. Tal charla tuvo excelente aceptación en el público, conformado por los expertos mundiales más importantes en la investigación de Tuberculosis. Felicitaciones para Andrea y gracias tanto por representarnos a CorpoGen como por representar la investigación en Micobacterias que se hace en Colombia.

Alejandro Reyes, microbiólogo investigador de CorpoGen esta realizando desde el 2007 su tesis doctoral en el Laboratorio del Prof. Jeff Gordon, Gordon Lab, School of Medicine, Washington University in Saint Louis, el experto mundial que está produciendo los estudios de mayor impacto en el tema de microbioma humano. Un merecido lugar para Alejandro, un joven investigador de capacidad excepcional. Muchas felicitaciones y le deseamos lo mejor en sus estudios.


Publicaciones destacadas

Biomédica, revista producida en Colombia e indexada internacionalmente que publica tras revisión de pares artículos de investigación en los temas de salud más importante del país, acaba de aprobar para publicación el artículo de los resultados de investigación conjunta entre CorpoGen y la Universidad de los Andes, bajo la autoría de los científicos Diego Chaves, Andrea Sandoval, Luis Rodríguez, Juan Carlos García, Silvia Restrepo y Maria Mercedes Zambrano.  Tal artículo, titulado  "Análisis comparativo de seis genomas del complejo Mycobacterium tuberculosis" puede ser descargado aquí

Environmental Microbiology, una prestigiosa revista internacional de Wiley- Blackwell Publishing, especializada en la publicación artículos de investigación en Microbiología Ambiental y Ecología Microbiana, ha aceptado el artículo titulado "Metagenomics reveals diversity and abundance of meta-cleavage pathways in microbial communities from soil highly contaminated with jet fuel under air-sparging bioremediation", con la coautoría del investigador de CorpoGen, Howard Junca, como parte de un trabajo colaborativo de laboratorios de Alemania y República Checa. Adicionalmente, Journal of Bacteriology, una de las publicaciones emblemáticas de la Sociedad Estadounidense de Microbiología (American Society for Microbiology), ha aceptado para publicación el artículo titulado Characterization of a gene cluster involved in 4-chlorocatechol degradation by Pseudomonas reinekei MT1. en el cual Howard también ha participado como coautor del estudio. 

Horizon Press (Horizon Scientific Press | Caister Academic Press) ha publicado el libro "Metagenomics: Theory, Methods and Applications" en el cual investigadores de CorpoGen (Andres Cubillos, Howard Junca y Maria Mercedes Zambrano) en conjunto con Investigadores de la Universidad Javeriana (Sandra Baena e Ivonne Vanegas Balzer), socios en el centro GeBiX, han sido invitados para escribir el capítulo 2 "Beyond Metagenomics: Integration of Complementary Approaches for the Study of Microbial Communities "

BMC Research Notes, revista de acceso libre publicada por BioMed Central  ha aceptado y publicado el artículo producido por los investigadores de CorpoGen, Andrés Cubillos y Maria Mercedes Zambrano, y Juan Morales de Ingenian Software, titulado "Analysis of the genetic variation in Mycobacterium tuberculosis strains by multiple genome alignments". El texto completo de éste artículo está disponible gratuitamente en los siguientes vínculos: Formato PDF | Formato html