Análisis de cepas de Mycobacterium tuberculosis con diferencias en transmisibilidad

Se buscan posibles diferencias genéticas, mediante el análisis de los sitios de inserción del elemento IS6110 y por genómica comparativa, que puedan estar correlacionadas con diferencias en transmisibilidad en cepas de M. tuberculosis aisladas durante brotes ocurridos en Argentina y Colombia. Proyecto del CCITB y colaboración con ANLIS Instituto Carlos Malbrán, Argentina.

Análisis de enzimas de reparación del ADN y su papel en la aparición de resistencia a antibióticos en Mycobacterium tuberculosis

Se están analizando las secuencias de genes de reparación de ADN en M. tuberculosis con el fin de identificar si existe alguna correlación entre posibles polimorfismos de secuencia y el fenotipo de multirresistencia a drogas anti-tuberculosas. Colaboración con CIB, Medellín y ANLIS Inst. Carlos Malbrán, Argentina.

Diguanilato ciclasa y su posible rol en el comportamiento multicelular de M. tuberculosis.

Mycobacterium tuberculosis ha desarrollado mecanismos que le permiten adaptarse a cambios ambientales, esto es evidente en el estado latente de la infección, en el cual, el bacilo se enfrenta a condiciones generadas por el ambiente intracelular dentro del macrófago. Nosotros estamos estudiando el comportamiento multicelular de las micobacterias como un posible mecanismo de adaptación, específicamente, estamos investigando el papel de la proteína diguanilato ciclasa y su producto, c-di- GMP, el cual es un segundo mensajero que ha sido implicado en la virulencia y patogénesis en otros sistemas bacterianos.

Genómica comparativa de cepas del complejo M. tuberculosis para la identificación de potenciales blancos para drogas.

A partir de una aproximación de genómica comparativa in silico en la cual se comparan genomas tanto de micobacterias patógenas como no patógenas, se busca identificar genes presentes únicamente en las micobacterias patógenas que puedan servir como candidatos para el tratamiento de la tuberculosis. Este proyecto se realiza en colaboración con Silvia Leaö de la Escuela Paulista de Medicina de la Universidad Federal de Sao Paulo, Silvia Restrepo del Laboratorio de Micología y Fitopatología (LAMFU) de la Universidad de los Andes y Alan Mitchell Durham del Instituto de Matemática y Estadística, Departamento de Ciencia de Computación de la Universidad de Sao Paulo, Brasil.

Evaluación de la diversidad de bacterias diazótrofas en el sur del Trapecio Amazónico

En colaboración con el instituto Sinchi se están analizando bacterias fijadoras de nitrógeno, con el fin de establecer una colección de microorganismos con potencial como biofertilizante y proporcionar una alternativa para mejorar la productividad de los suelos ácidos y poco fértiles del trapecio amazónico colombiano.

Desarrollo de diagnósticos moleculares para Mycobacterium tuberculosis