|
|
| CorpoGen > Ecología Microbiana > Home |
| |
|
EM-CG |
BIENVENIDO! Página del Grupo de Investigación: ECOLOGÍA MICROBIANA - CORPOGEN (EM-CG) Metabolismo, Genómica y Evolución de Comunidades de Microorganismos Ambientales | CorpoGen
Hacemos investigación y bioprospección de la diversidad microbiana en múltiples ecosistemas terrestres y acuáticos del planeta, por medio de tecnologías de vanguardia en ecología microbiana, códigos de barras de ADN, metagenómica funcional, bioquímica, filogenia molecular y microbiología ambiental, generando conocimiento básico y aplicado para:
• Mejores y más avanzadas descripciones y estimulaciones de procesos de biorremediación ambiental. • Más precisa y adecuada categorización de especies biológicas y de estructuras de comunidades en variados ambientes (micro, macroorganismos y asociaciones hologenómicas) de acuerdo a los consensos y tecnologías disponibles de última generación. • Generación de nuevos productos, metabolitos o sustratos con potencial farmacéutico o industrial. • Descubrimiento de nuevos catalizadores biotecnológicos y para la determinación de los programas genéticos que originan compuestos con bioactividades relevantes para la salud humana, para la recuperación de ambientes y para procesos de manufactura más eficientes.
Tenemos una convicción por trabajar prioritariamente en proyectos científicos que ulteriormente promuevan un uso sostenible, justo, racional, responsable e inteligente de nuestros recursos, y un compromiso por realizar investigación que favorezca el desarrollo de la ciencias ómicas en nuestro país, reforzando y apoyando los programas y políticas nacionales que sean destinadas a incentivarlas de forma sostenida y organizada, lo cual permite la obtención de resultados científicos y tecnológicos significativos y perdurables como un paso para transformar nuestra sociedad hacia el conocimiento. En ese esfuerzo, nos concentramos en formar y entrenar nuevos investigadores de alto nivel y capacidad, bajo estándares que buscan impacto científico y competitividad internacional, y a la vez atendiendo necesidades locales presentes y futuras desde nuestras competencias de investigación, contribuyendo así a expandir una visión científica, coherente, colaborativa, recíproca y abierta con los investigadores, estudiantes y comunidades interesadas en esta iniciativa y témáticas
RG Ecología Microbiana - CorpoGen Carrera 5 # 66A-34 110231, Bogotá, Colombia www.corpogen.org/ecologiamicrobiana
Howard Junca (Jefe de Grupo Investigación) [web]
Álvaro Monguí (Investigador MSc y Tesista Doctoral asociado a proyecto) [pdf]
César Osorio (Investigador BSc, Investigador GeBiX) [pdf]
Martha Cepeda (Investigadora MSc asociada a proyecto)[pdf]
Eric Gálvez (Investigador BSc y Tesista MSc asociado a proyecto)[pdf]
Katerine Carrillo (Investigadora MSc asociada a proyecto) [pdf]
Francy Pérez (Investigadora BSc asociada a proyecto) [-]
Juan Manuel Anzola (Investigador PhD Asociado, Jefe Área Bioinformática)
José Ricardo Bustos (Ingeniero, Investigador MSc Asociado)
El Grupo de Investigación "Ecología Microbiana - Metabolismo, Genómica y Evolución de Comunidades de Microorganismos Ambientales | CorpoGen" (abrev. Ecología Microbiana - CorpoGen) fué establecido en Enero de 2010 por el Dr. Howard Junca, tras retornar al país e incorporarse a CorpoGen, centro aútonomo de investigación sin ánimo de lucro, localizado en Bogotá [+]. En los primeros años de CorpoGen y recién graduado de Microbiología en la Universidad de los Andes, el Dr. Junca fué uno de los primeros beneficiados por el programa Jóvenes Investigadores [+] de Colciencias en el año 1998, que permitió su entrenamiento en proyectos de investigación que aplicaban técnicas de biología molecular en las cuales CorpoGen ha sido uno de los centros pioneros en su implementación y desarrollo en el país [+]. Después de realizar estudios de posgrado, doctorado, y ser investigador federal postdoctoral en Alemania [+], y gracias al apoyo y acogida en los grupos de amplia trayectoria de las fundadoras del centro, Genética Molecular (María Mercedes Zambrano Eder [+]) y Biotecnología Molecular (Patricia Del Portillo [+]), a finales del 2008 se vincula nuevamente a CorpoGen, financiado como investigador postdoctoral del Centro de Excelencia en Investigación - Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática - GeBiX [+], coordinado desde CorpoGen por la Dra. Zambrano. En el año 2009 se presentaron dos propuestas de proyectos nacionales y una propuesta para participación en un consorcio de investigación europeo FP7 que fueron aprobadas en temáticas concretas de investigación y con personal investigador financiado (ver sección Proyectos) que justificaron la creación de un grupo especializado en las líneas de investigación de ecología, metabolismo y genómica microbiana, que son transversales, con potenciales muy amplios en bioprospección, biotecnología y biorremediación, y en temáticas complementarias a las áreas de CorpoGen, aumentando las capacidades conjuntas de los grupos y el centro receptor.
Exploración metagenómica de las comunidades microbianas asociadas a esponjas: en busca de los orígenes arcaicos y naturales del potencial generador/degradador de aromáticos halogenados. [+] Financiado por Colciencias-CorpoGen, PI Howard Junca (CorpoGen), colaboración científica y asesoría de Dr. Olivier P. Thomas (Universidad Sophie-Nice) y Dr. Thierry Perez (U. Marseille)
Plataforma de exploración de antimaláricos en metagenomas Financiado por Colciencias-CorpoGen, PI Howard Junca (CorpoGen), participantes Dr. Magally Romero y Dr. Sergio Orduz (Universidad Nacional de Colombia, Sede Medellín) y colaboración científica y asesoría de Dra. Carmen Fernández-Becerra y Dr. Hernando Del Portillo (CRESIB, Barcelona)
MAGICPAH - Molecular Approaches and MetaGenomic Investigations for optimizing Clean-up of PAH contaminated sites. Participantes en el consorcio de investigación financiado por la comisión europea en el séptimo programa marco de investigación de la Unión Europea. CorpoGen participa como únicos socio externos a la EU. PI Dietmar Pieper (HZI). Red de investigación de 14 laboratorios de 7 países. www.magicpah.org
Participante en el proyecto de la red colombiana de investigación "Centro de Investigación de Excelencia GeBiX¨: Creación de una plataforma metagenómica y bioinformática para la caracterización y el uso de los recursos genéticos de ambientes extremos. Consiste en 14 laboratorios en 5 instituciones de varias regiones del país. www.gebix.org.co
Parte colombiana del proyecto bilateral de investigación financiado por Brasil (CNPq) y Colombia (Colciencias) de CorpoGen con el Centro de Biotecnología, Universidad Federal de Rio Grande do Sul (Dr. Alexandre J. Macedo [+]).
PUBLICACIONES ISI E INDEXADAS EN PUBMED
Molinate hydrolase from Gulosibacter molinativorax ON4T - a novel cobalt dependent amidohydrolase. Duarte M, Ferreira-da-Silva F, Lünsdorf H, Junca H, Gales L, Pieper DH, Nunes OC. J Bacteriol. 2011 Aug 12. [Epub ahead of print] PMID: 21840982
In-depth characterization via complementing culture-independent approaches of the microbial community in an acidic hot spring of the Colombian Andes. Bohorquez L, Delgado-Serrano L, López G, Osorio-Forero C, Klepac-Ceraj V, Kolter R, Junca H, Baena S, Zambrano M. Microbial Ecology. 2011. In press
Genome sequences of Alicycliphilus denitrificans strain BC and K601T. Oosterkamp MJ, Veuskens T, Plugge CM, Langenhoff AA, Gerritse J, van Berkel WJ, Pieper DH, Junca H, Goodwin LA, Daligault HE, Bruce DC, Detter JC, Tapia R, Han CS, Land ML, Hauser LJ, Smidt H, Stams AJ. J Bacteriol. 2011 Jul 8. [Epub ahead of print] PMID: 21742888
Metabolic networks, microbial ecology and 'omics' technologies: towards understanding in situ biodegradation processes. Review. Vilchez-Vargas R, Junca H, Pieper DH. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3089-104. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02340.x. PMID: 20860734
Mangrove microniches determine the structural and functional diversity of enriched petroleum hydrocarbon-degrading consortia. Gomes NC, Flocco CG, Costa R, Junca H, Vilchez R, Pieper DH, Krögerrecklenfort E, Paranhos R, Mendonça-Hagler LC, Smalla K. FEMS Microbiol Ecol. 2010 Nov;74(2):276-90. doi: 10.1111/j.1574-6941.2010.00962.x. Epub 2010 Aug 31. PMID: 20812953
Metagenomics reveals diversity and abundance of meta-cleavage pathways in microbial communities from soil highly contaminated with jet fuel under air-sparging bioremediation. Brennerova MV, Josefiova J, Brenner V, Pieper DH, Junca H. Environ Microbiol. 2009 Sep;11(9):2216-27. PMID: 19575758
Characterization of a gene cluster involved in 4-chlorocatechol degradation by Pseudomonas reinekei MT1. Cámara B, Nikodem P, Bielecki P, Bobadilla R, Junca H, Pieper DH. J Bacteriol. 2009 Aug;191(15):4905-15. PMID: 19465655
Growth of Pseudomonas chloritidismutans AW-1(T) on n-alkanes with chlorate as electron acceptor. Mehboob F, Junca H, Schraa G, Stams AJ. Appl Microbiol Biotechnol. 2009 Jun;83(4):739-47. PMID: 19352644
Enhancement of the microbial community biomass and diversity during air sparging bioremediation of a soil highly contaminated with kerosene and BTEX. Kabelitz N, Machackova J, Imfeld G, Brennerova M, Pieper DH, Heipieper HJ, Junca H. Appl Microbiol Biotechnol. 2009 Mar;82(3):565-77. PMID: 19172262
Isolation and characterization of Alicycliphilus denitrificans strain BC, which grows on benzene with chlorate as the electron acceptor. Weelink SA, Tan NC, ten Broeke H, van den Kieboom C, van Doesburg W, Langenhoff AA, Gerritse J, Junca H, Stams AJ. Appl Environ Microbiol. 2008 Nov;74(21):6672-81. PMID: 18791031
25 de Agosto de 2011 www.corpogen.org/ecologiamicrobiana
"Micronaut"- cortesía de http://margenelk.blogspot.com/
|
![[+]](METASPONBanner3.jpg){kind=link}